熱鬧的多人線上遊戲「THE NEW GATE」突然變了樣，將人們困在遊戲世界中，讓他們苦不堪言。為了打破這種狀況，遊戲中最強的玩家之一的青年—— シン 站了出來。阻擋在他面前的是這個世界的最大敵人＜起源（オリジン）＞。「結束了...！！！」苦戰的最後，シン 用他的太刀貫穿了＜起源＞的身體。遊戲通關的公告聲響起，告知囚禁的玩家們獲得了解放。人們陸續從遊戲登出，シン也是一樣，準備和這個熟悉的世界告別。但就在此時，突然開啟了一扇新的門——被光芒包圍後的 シン，在他面前蔓延開的是……遊戲通關後500年的「THE NEW GATE」世界！