世界突然出现了身高15米的迷之怪物“巨人”捕食着人类。面临着生存危机而残存下来的人类，建造了三重巨大防护墙以确保内侧生活圈的安全。人类生命得以延续，在这隔绝的环境里享受了一百年的和平。直到艾伦·耶格尔十岁那年，突然出现一个前所未见的“超大型巨人”。其用压倒性的力量破坏了城门后瞬间消失，巨人们成群地冲进墙内捕食人类。艾伦看到了邻居、伙伴、母亲先后被巨人杀死，怀着对巨人无以形容的恨意，誓言杀死全部巨人。母亲死亡、父亲失踪，其父可能掌握了巨人之谜。艾伦在同期生里有着其他人无法比拟的强悍精神力，即使见过地狱也依然向巨人挑战，进而加入向往以久的调查兵团。然而，巨人摧残人类，真的是世界对人类的惩罚吗？看似简单的表面世界之下，隐藏着血淋淋而残酷的世间真相……